中澳植病生防合作研究中心，于2011年10月经山东省科技厅批准，由山东省科学院生态研究所（原山东省科学院中日友好生物技术研究中心）和澳大利亚国家科学院水土研究所（CSRIO）、南澳大利亚研究与发展中心（SARDI）联合建立。

中澳植病生防合作研究中心主要开展植物病害的生物防治分子机理研究，重点研究有益微生物施入土壤中后菌株的存活与定殖能力，以及木霉基因组、转录组学研究，探讨植物-有益微生物-病原菌三者之间的相互关系。